Černé skvrny na plodech rajčat, jsou velmi častým poškozením. Černé skvrny způsobují dva druhy onemocnění, které jsou si svými příznaky velmi podobné. Mezi další choroby rajčat patří bronzovitost, plíseň, hnědá skvrnitost a bakteriální vadnutí.
Terminální nekróza plodů se objevuje převážně u rostlin pěstovaných pod sklem nebo folií (ve sklenících, fóliovnících). Skvrny mají nejprve vodnatý charakter a objevují se u nezralých i dozrávajících plodů kolem čnělky. Později tmavnou až zčernají. Příčinou tohoto onemocnění je nerovnoměrná zálivka a nevyvážený poměr živin v půdě. )
Častějším onemocněním, které způsobuje zpočátku šedozelené, později tmavé zeleně lemované skvrny, je plíseň bramborová. Mimo plody napadá plíseň bramborová i listy a lodyhy rajčat. Plíseň se objevuje během léta v obdobích dešťových srážek.
Ochranou proti plísni bramborové a terminální nekróze jsou účinné, včasné a opakované postřiky fungicidními přípravky Dithane M 45 0,2%, Perozin 75B 0,4% nebo Kuprikol 50 0,6%. Účinnou prevencí, jak se vyvarovat plísni a nekróze rajčat, je nevysazovat rajčata příliš hustě a při zálivce se vyvarovat kropení listů. Mladé sazenice zaléváme jen ke kořenům.
